Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Gtf3c6Q9D8P7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c6Q9D8P7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c6Q9D8P7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c6Q9D8P7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf3c6Q9D8P7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf3c6Q9D8P7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf3c6Q9D8P7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Gtf3c6Q9D8P7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Gtf3c6Q9D8P7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Gtf3c6Q9D8P7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Gtf3c6Q9D8P7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Gtf3c6Q9D8P7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Gtf3c6Q9D8P7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c6Q9D8P7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Gtf3c6Q9D8P7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Gtf3c6Q9D8P7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Gtf3c6Q9D8P7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gtf3c6Q9D8P7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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