Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med11Q9D8C6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med11Q9D8C6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms