Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Jam3Q9D8B7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jam3Q9D8B7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jam3Q9D8B7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms