Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp4bQ9D8B3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp4bQ9D8B3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp4bQ9D8B3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 497.5 ms