Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tube1Q9D6T1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tube1Q9D6T1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms