Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G3

2900055J20Rik, RIKEN cDNA 2900055J20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900055J20RikQ9D6G3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2900055J20RikQ9D6G3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2900055J20RikQ9D6G3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms