Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Ptp4a3Q9D658 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptp4a3Q9D658 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Ptp4a3Q9D658 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Ptp4a3Q9D658 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ptp4a3Q9D658 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ptp4a3Q9D658 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptp4a3Q9D658 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptp4a3Q9D658 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptp4a3Q9D658 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptp4a3Q9D658 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptp4a3Q9D658 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms