Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lpcat2bQ9D5U0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpcat2bQ9D5U0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpcat2bQ9D5U0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms