Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4f1Q9D5Q6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4f1Q9D5Q6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms