Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Spsb1Q9D5L7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spsb1Q9D5L7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms