Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D4W2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D4W2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D4W2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D4W2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D4W2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms