Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce1Q9D495 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms