Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpn3Q9D3W4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpn3Q9D3W4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.9 ms