Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pus10Q9D3U0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pus10Q9D3U0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pus10Q9D3U0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pus10Q9D3U0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pus10Q9D3U0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms