Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms