Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a4cQ9D3F6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a4cQ9D3F6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms