Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stag1Q9D3E6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag1Q9D3E6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms