Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Fndc8Q9D2H8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fndc8Q9D2H8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Fndc8Q9D2H8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Fndc8Q9D2H8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Fndc8Q9D2H8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fndc8Q9D2H8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms