Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef12Q9D2F1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef12Q9D2F1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms