Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Batf3Q9D275 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms