Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TbcbQ9D1E6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TbcbQ9D1E6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms