Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Susd3Q9D176 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms