Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssbp3Q9D032 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssbp3Q9D032 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms