Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmem39aQ9CYC3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms