Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Xrcc3Q9CXE6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Xrcc3Q9CXE6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Xrcc3Q9CXE6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc3Q9CXE6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc3Q9CXE6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Xrcc3Q9CXE6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Xrcc3Q9CXE6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Xrcc3Q9CXE6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Xrcc3Q9CXE6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Xrcc3Q9CXE6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc3Q9CXE6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Xrcc3Q9CXE6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc3Q9CXE6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc3Q9CXE6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc3Q9CXE6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc3Q9CXE6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xrcc3Q9CXE6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Xrcc3Q9CXE6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Xrcc3Q9CXE6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc3Q9CXE6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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