Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX92

Gje1, Gap junction epsilon-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gje1Q9CX92 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gje1Q9CX92 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gje1Q9CX92 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gje1Q9CX92 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gje1Q9CX92 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gje1Q9CX92 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gje1Q9CX92 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gje1Q9CX92 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gje1Q9CX92 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gje1Q9CX92 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gje1Q9CX92 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gje1Q9CX92 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gje1Q9CX92 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gje1Q9CX92 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gje1Q9CX92 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gje1Q9CX92 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms