Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm8aQ9CWZ3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm8aQ9CWZ3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm8aQ9CWZ3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm8aQ9CWZ3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm8aQ9CWZ3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm8aQ9CWZ3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm8aQ9CWZ3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm8aQ9CWZ3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbm8aQ9CWZ3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbm8aQ9CWZ3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms