Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BccipQ9CWI3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BccipQ9CWI3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BccipQ9CWI3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms