Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atxn3Q9CVD2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms