Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Sycp2Q9CUU3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Sycp2Q9CUU3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Sycp2Q9CUU3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Sycp2Q9CUU3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms