Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms