Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifitm3Q9CQW9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms