Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc2Q9CQP2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.2 ms