Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nicn1Q9CQM0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nicn1Q9CQM0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms