Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rdm1Q9CQK3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms