Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ubl4bQ9CQ84 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ubl4bQ9CQ84 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ubl4bQ9CQ84 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ubl4bQ9CQ84 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms