Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3bpQ9CQ82 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms