Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg3Q9CPX6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg3Q9CPX6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms