Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt88Q9CPR6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt88Q9CPR6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms