Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf8Q99PV0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms