Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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