Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL8

Slc19a3, Thiamine transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a3Q99PL8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc19a3Q99PL8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc19a3Q99PL8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms