Protein–RNA interactions for Protein: Q99PB1

1700020D05Rik, Mage-g2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700020D05RikQ99PB1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700020D05RikQ99PB1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700020D05RikQ99PB1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms