Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NsmfQ99NF2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NsmfQ99NF2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms