Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rims1Q99NE5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rims1Q99NE5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rims1Q99NE5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms