Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atoh8Q99NA2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms