Protein–RNA interactions for Protein: Q99N43

Kremen1, Kremen protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kremen1Q99N43 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kremen1Q99N43 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kremen1Q99N43 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kremen1Q99N43 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kremen1Q99N43 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kremen1Q99N43 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kremen1Q99N43 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kremen1Q99N43 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kremen1Q99N43 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kremen1Q99N43 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kremen1Q99N43 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms