Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cadm3Q99N28 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms