Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brms1Q99N20 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms