Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SncaipQ99ME3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SncaipQ99ME3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms