Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tnpo2Q99LG2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnpo2Q99LG2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms